Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVPABLB-1P60509 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.8 ms