Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTPAP49638 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTPAP49638 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms