Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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