Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRGP23470 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRGP23470 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRGP23470 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRGP23470 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRGP23470 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRGP23470 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRGP23470 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
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