Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms