Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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LRRTM2O43300 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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LRRTM2O43300 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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LRRTM2O43300 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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LRRTM2O43300 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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