Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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