Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TMOD3Q9NYL9 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms