Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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