Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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HOXD1Q9GZZ0 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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HOXD1Q9GZZ0 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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HOXD1Q9GZZ0 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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HOXD1Q9GZZ0 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD1Q9GZZ0 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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