Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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