Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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