Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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RTL8BQ17RB0 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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RTL8BQ17RB0 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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RTL8BQ17RB0 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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