Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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