Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms