Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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