Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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NKX1-1Q15270 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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NKX1-1Q15270 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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NKX1-1Q15270 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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NKX1-1Q15270 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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