Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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PDK3Q15120 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDK3Q15120 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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