Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NCF4Q15080 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NCF4Q15080 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NCF4Q15080 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NCF4Q15080 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NCF4Q15080 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NCF4Q15080 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCF4Q15080 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms