Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL19A1Q14993 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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