Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms