Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MDC1Q14676 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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