Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms