Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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