Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms