Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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HTR4Q13639 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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HTR4Q13639 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HTR4Q13639 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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