Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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