Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms