Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms