Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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