Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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