Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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