Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms