Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms