Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATRXP46100 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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