Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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PTPRDP23468 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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PTPRDP23468 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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PTPRDP23468 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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PTPRDP23468 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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PTPRDP23468 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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