Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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