Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xpr1Q9Z0U0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms