Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms