Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms