Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms