Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM248Q9NWD8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms