Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r46Q9EQ45 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms