Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms