Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms