Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms