Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms