Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf6Q99NA9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms