Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx4Q91YJ2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx4Q91YJ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms