Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd3Q8K2F0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms